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按培养基组成物质的化学成分化学发光试剂区分
根据对培养组成物质的化学成分是否完全了解来区分，可以将培养基分为天然培养基、合成培养基和半合成培养基。
（1）天然培养基。天然培养基是指利用各种动、植物或微生物的原料，其成分难以确切知道。例如培养细菌常用的肉汤蛋白胨培养基：牛肉膏3g，蛋白胨5g，水1000mL。
用做这种培养基的主要原料有：牛肉膏、麦芽汁、蛋白胨、酵母膏、玉米粉、麸皮、各种饼粉、马铃薯、牛奶、血清等。用这些物质配成的培养基虽然不能确切知道它的化学成分，但一般来讲，营养是比较丰富的，微生物生长旺盛，而且来源广泛，配制方便，所以较为常用，尤其适合于配制实验室常用的培养基和大生产上的培养基。
这种培养基的稳定性常受生产厂或批号等因素的影响，另外自养微生物一般不能在其上面生长。
（2）合成培养基。合成培养基是一类化学成分和数量完全知道的培养基，它是用已知化学成分的化学药品配制而成。例如培养细菌的葡萄糖铵盐培养基：C6H12O60.2%，K2HPO40.7%，KH2PO4 0.3%，Na3C6H5O70.05%，MgSO4·7H2O0.01%，（NH4）2SO40.1%，H2O 100mL。
这类培养基化学成分精确、重复性强，但价格昂贵，而微生物又生长缓慢，所以它只适用于做一些科学研究，例如营养、代谢的研究。
（3）半合成培养基。在合成培养基中，加入某种或几种天然成分；或者在天然培养基中，加入一种或几种已知成分的化学药品即成半合成培养基。例如马铃薯蔗糖培养基等。如果在合成培养基中加入琼脂，由于琼脂中含有较多的化学成分不太清楚的杂质，故也只能算是半合成培养基。这种培养基在生产实践和实验室中使用最多。
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