科学家发明RNA测序新方法——检测亚细胞水平转录组空间分布

斯坦福大学研究团队在RNA测序方面取得突破性进展，发明了一种亚细胞水平转录组空间分布的RNA测序新方法，研究论文于近日在线发表于国际期刊Cell，论文标题为“Atlas of subcellular RNA localization revealed by APEX-Seq”。

该研究发明了一种名为APEX-Seq的RNA测序技术，通过基因编码的过氧化氢酶APEX2（engineered ascorbate peroxidase 2）经过H2O2催化1分钟后，直接在活细胞内对指定区域（利用特异性融合蛋白或定位信号将APEX定位在目标区域）的RNA进行高精度的生物素标记，利用亲和素修饰的磁珠对标记的RNA富集以进行深度测序。该研究对包括细胞核、核孔、核纤层、核仁、细胞质、内质网外膜、内质网内膜、线粒体基质、线粒体外膜在内的9个亚细胞区域/结构的RNA组成进行了全面的分析，绘制了HEK293细胞内以这9个位置为坐标的转录组空间分布图谱，以及细胞在不同刺激下部分区域RNA分布的动态变化。 

科学家发现新疗法可促进脑卒中后血管再生

已知中风后，抑制信号分子Nogo-A的抗体可以帮助修复受影响大脑区域的血管。近日，来自瑞士苏黎世大学（UZH）的一个研究团队在小鼠模型中发现，它也能促进运动功能的恢复。这项研究6月24日已发表在美国国家科学院院刊（PNAS）上，为治疗开辟了新途径。

在瑞士，每年约有1.6万人中风，全世界大约有1500万人中风。由于大脑再生受损组织和神经回路的能力有限，导致三分之二的患者死亡或不能自理。目前，尽管进行了大量的研究工作，但只有少数几种药物疗法可以减少脑卒中后的严重后果。

一种颇有前景促进生理功能恢复的新方法是修复受损脑区的血管系统。血管系统为受伤的组织提供氧气和关键营养素。在中风患者中，这种修复过程受到多种机制的抑制。几年前，UZH大学Martin Schwab教授的研究小组使用了一个小鼠模型来证明，信号分子Nogo-A不仅能减少神经纤维的生长，还能调节大脑中血管的生长，从而抑制它们的修复。

在一项针对小鼠的新研究中，研究人员对Nogo-A分子和其相应的受体之一S1PR2进行基因失活。这些小鼠的血管显示出改善的再生能力，并且它们比对照组小鼠更好地恢复了受影响的运动技能。这些发现是在治疗中得到了重现，在中风后的小鼠中使用抗Nogo-A抗体，也使得在受影响的脑区周围重建强大且功能性的血管网络。

研究第一作者、UZH神经科学家Ruslan Rust说，“接受治疗的小鼠，其神经系统显示出更好的恢复能力，它们的运动功能受影响较小，我们将其归因于血管再生。”

以前的增强血管生长的实验几乎完全集中在血管生长因子的补充，由于其严重的副作用，如出血风险增加，导致这种方法在临床上是不可行的。

Rust说：“我们的发现为治疗中风患者提供了一个很有前景的替代方法，尤其是因为抗Nogo-A抗体已被用于脊髓损伤的临床试验。”

美国约翰霍普金斯大学开发出肿瘤“液体活检”新方法

肿瘤无创诊断技术，即液体活检（liquid biopsies）的出现，标志着人类在攻克肿瘤的道路上又前进了一大步。日前，来自美国约翰霍普金斯医院的团队在Nature发文，论文标题为“Genome-wide cell-free DNA fragmentation in patients with cancer”，介绍了一种新型的肿瘤液体活检技术。

外周血游离DNA（circulating fragment DNA, cfDNA）检测是液体活检技术的关键组成之一。该团队对208例恶性肿瘤患者的cfDNA进行全基因组测序，作为对照，他们还对215名健康个体的cfDNA进行了全基因组测序。这种被称为DELFI (DNA evaluation of fragments for early interception) 的新技术通过利用获取的cfDNA片段信息与参考人群进行比较来筛查肿瘤。结果发现，DELFI对恶性肿瘤的检出率达73%，特异性高达98%。该检测还发现，在确定cfDNA的组织来源方面，准确率为61%-75%。将DELFI和基于突变的cfDNA分析相结合，研究人员可以将检测准确度提高至91%。

这项创新技术为液体活检应用于恶性肿瘤的筛查带来了新希望。 

我国科学家发现鼻咽癌EB病毒高危亚型

近日，中山大学肿瘤防治中心曾益新院士团队与合作伙伴共同努力，在EB病毒致癌研究领域取得了重要进展：通过对来自鼻咽癌高发及低发区的EB病毒进行全测序分析，发现了与鼻咽癌有关的高致病性EB病毒亚型。该高危亚型是迄今为止发现的与鼻咽癌发生相关的最大风险因素，对于研发鼻咽癌预防性疫苗及开展高危人群的早期筛查具有重要意义。该研究以题为“全基因组测序鉴定鼻咽癌相关的EB病毒高危亚型”于2019年6月17日以论文形式在顶级学术期刊《自然·遗传》（Nature Genetics）发表。

该研究发现高于80%的鼻咽癌病例都感染了高危EB病毒亚型，因此，通过基因分型技术在人群中检测是否携带高危亚型，结合发病风险预测就能够锁定鼻咽癌发病风险高的人群。目前，基于EB病毒高危亚型（EBV-BALF2分型）和曾益新院士科研团队在早前的研究中确立的7个和鼻咽癌发病密切相关的基因位点，开发了新一代鼻咽癌发病风险预测芯片，已在中山大学肿瘤防治中心的分子诊断科和体检中心作为院内临床检验项目正式开展。对于有鼻咽癌家族史、携带EB病毒高危亚型和遗传易感因素的高危人群，建议进行定期鼻咽癌筛查，如血液中EB病毒抗体、鼻咽纤维镜和头颈MRI检查，有望提高鼻咽癌早诊率，从而治愈鼻咽癌，实现疾病的二级预防。

《柳叶刀》发表文章分析中国30年疾病负担变化趋势

近日，中国疾病预防控制中心、美国华盛顿大学等单位联合开展研究，系统分析了我国1990年至2017年疾病负担变化趋势。相关研究结果发表于国际顶尖期刊《柳叶刀》，论文标题为“Mortality, morbidity and risk factors in China and its provinces, 1990—2017:a systematic analysis for the global burden of disease study 2017”。

研究结果显示，2017年我国人群前五位主要死亡原因为中风、缺血性心脏病、肺癌、慢性阻塞性肺病（COPD）和肝癌，而1990年为下呼吸道感染、新生儿疾病、中风、COPD和交通事故。尽管中风年龄标化死亡率自1990年下降33.5%，但其仍为影响我国人群寿命的“头号杀手”，而缺血性心脏病、肺癌排名分别由1990年的第7、13位跃升至2017年的第2、3位，其年龄标化死亡率分别增加20.6%和28.2%。同时，在排名前25位的疾病中，与1990年相比，COPD、新生儿疾病、下呼吸道感染、自残、肝硬化、其他慢性肝病、先天性出生缺陷和溺水年龄标化死亡率下降50%之多。研究还发现，高血压、吸烟、高钠饮食、空气污染、高血糖、高胆固醇、高体重指数、谷物蔬果摄入不足和饮酒是位列前十的死亡危险因素。此外，疾病分布存在地区差异，东部、沿海地区与经济发达省份疾病负担较小。

该研究结果反映，近30年我国与传染性、孕产妇、新生儿和营养状况相关的疾病负担呈大幅下降趋势，而非传染性疾病导致的疫病负担日益凸显，提示未来公共卫生政策应优先关注慢性疾病。  

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